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        分析實(shí)時(shí)PCR實(shí)驗(yàn)的步驟及注意事項(xiàng)

        發(fā)布時(shí)間: 2025-06-26  點(diǎn)擊次數(shù): 388次
          實(shí)時(shí)PCR實(shí)驗(yàn),也稱為實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qPCR),是一種在PCR擴(kuò)增反應(yīng)中加入熒光基團(tuán),通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào)積累來(lái)監(jiān)測(cè)每次PCR循環(huán)后產(chǎn)物總量,進(jìn)而對(duì)待測(cè)樣品中的目的序列進(jìn)行定量分析的方法。
          實(shí)時(shí)PCR實(shí)驗(yàn)的原理是在PCR反應(yīng)體系中加入熒光染料(如SYBR Green)或熒光探針(如TaqMan探針)。這些熒光物質(zhì)可以與DNA雙鏈結(jié)合,并在PCR擴(kuò)增過(guò)程中隨著DNA的增加而發(fā)出熒光信號(hào)。熒光信號(hào)的強(qiáng)度與PCR產(chǎn)物的量成正比,從而可以通過(guò)熒光信號(hào)強(qiáng)度來(lái)推算出目標(biāo)DNA或RNA的起始濃度。
          1、樣品準(zhǔn)備:包括細(xì)胞總RNA提取、RNA濃度測(cè)定、反轉(zhuǎn)錄合成cDNA模板等步驟。
          2、配樣:按照實(shí)驗(yàn)需要對(duì)cDNA模板加水作適當(dāng)稀釋,渦旋混勻后離心,根據(jù)實(shí)際所檢測(cè)樣品和基因的數(shù)量計(jì)算加樣體系,加入ddH2O、qPCR mix、引物等,配成一管mix,渦旋混勻后離心。
          3、加模板:在每個(gè)孔各加入一定量的cDNA模板,加樣完畢后蓋上管蓋,渦旋混勻后離心,去除氣泡。
          4、上機(jī)反應(yīng):設(shè)置反應(yīng)溫度、孔板信息等參數(shù),將樣品放入儀器中開始反應(yīng)。
          5、數(shù)據(jù)導(dǎo)出與分析:反應(yīng)結(jié)束后得到qPCR數(shù)據(jù),根據(jù)溶解曲線查看數(shù)據(jù)的有效性,導(dǎo)出數(shù)據(jù)為EXCEL文件并保存,進(jìn)行進(jìn)一步分析。
          實(shí)時(shí)PCR實(shí)驗(yàn)的注意事項(xiàng):
          1、防止污染:實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要嚴(yán)格遵守操作規(guī)程,防止擴(kuò)增序列的殘留污染和樣品間的交叉污染。
          2、準(zhǔn)確加樣:使用一次性吸頭,避免吸頭長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中,避免氣溶膠的污染。
          3、設(shè)立對(duì)照:操作時(shí)設(shè)立陰陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照,以驗(yàn)證PCR反應(yīng)的可靠性和擴(kuò)增系統(tǒng)的可信性。
          4、重復(fù)實(shí)驗(yàn):為了驗(yàn)證結(jié)果的準(zhǔn)確性,通常需要進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)。
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